محمد مخبر درباره چرایی عدم نامزدی‌اش در انتخابات ریاست‌جمهوری می‌گوید: تصور کنید من هم در کنار اداره کشور، کاندیدای انتخابات می‌شدم؛ این حجم سنگین از مسئولیت‌ها و درگیری‌ها را چگونه می‌توانستیم مدیریت کنیم؟ شاید بزرگ‌ترین اشتباه من این می‌بود که وارد رقابت انتخاباتی شوم.
به گزارش کاویان گلد، محمد مخبر معاون اول دولت سیزدهم در برنامه بدون تعارف گفت: من هیچ‌وقت علاقه‌ای به حضور در دولت نداشتم. رؤسای جمهور پیشین هم پیشنهادهایی در سطح وزارت داده بودند، اما همیشه ترجیح می‌دادم زیرمجموعه مستقیم دفتر حضرت آقا باشم. وقتی شهید رئیسی پیشنهاد معاون اولی را مطرح کردند، خواهش کردم که اجازه دهند در قالب مشاور، کارهای مدنظرشان را انجام دهم؛ اما ایشان نپذیرفتند و در نهایت، شرایطی فراهم شد که این مسئولیت را قبول کردم.
به روایت فارس، وی سپس به ۳۰ اردیبهشت و ساعات پراضطراب پس از ناپدیدشدن بالگرد حامل رئیس‌جمهور اشاره می‌کند: در محوطه دولت، دو نفر از دوستانم چهره‌شان نگران بود. گفتند چند ساعتی است از بالگرد خبری نیست. همان موقع بهشان گفتم چیزی نگویید. هنوز جلسه دولت تمام نشده بود که یادداشتی از دفتر حضرت آقا رسید. رفتم خدمت ایشان. بسیار متأثر بودند. هنوز هم مشخص نبود دقیقاً چه اتفاقی افتاده. حضرت آقا فرمودند یا شهید رئیسی مجروح شده‌اند که ان‌شاءالله بهبود می‌یابند، یا اینکه به شهادت رسیده‌اند؛ به هر حال باید آماده باشید کشور را بدون خلل اداره کنید.