اکبر گودرزی و افراد تحت امرش احساس کردند در این مقطع زمانی به مرحله «اجتهاد در ایدئولوژی» رسیدهاند و با برداشت ناصحیح از آثار و افکار دکتر شریعتی، نیروهای انقلابی و تأثیرگذار ازجمله سپهبد قرنی، آیتالله مطهری، حاج مهدی عراقی، آیتالله قاضی طباطبایی، آیتالله مفتح و … را در برداشت سهگانه «زر، زور، تزویر» قرار دادند و با صدور فتوای «اعدام انقلابی»، اقدام به ترور آنها کردند.
به گزارش کاویان گلد به نقل از پایگاه اطلاعرسانی مرکز اسناد انقلاب اسلامی؛ روز سوم خرداد ۱۳۵۹ اکبر گودرزی، رهبر و بنیانگذار گروه تروریستی فرقان اعدام شد. اکبر گودرزی متولد سال ۱۳۳۵ (یا به روایتی دیگر ۱۳۳۸) بود که تحصیلات حوزوی خود را ناتمام گذاشت. او جلسات تفسیر قرآن و سخنرانیهای خود را در مساجد تهران چند سال قبل از پیروزی انقلاب اسلامی آغاز کرد. گودرزی از میان همین جلسات، توانست گروهی کوچک اما گوش به فرمان از نوجوانان و جوانان تحت عنوان «فرقان» تشکیل دهد. گروه فرقان در بحبوحه پیروزی انقلاب و تأسیس نظام جدید سیاسی «جمهوری اسلامی»، با انتشار نشریهای به همین نام؛ اعلام موجودیت کرد. اکبر گودرزی و افراد تحت امرش احساس کردند در این مقطع زمانی به مرحله «اجتهاد در ایدئولوژی» رسیدهاند و با برداشت ناصحیح از آثار و افکار دکتر شریعتی، نیروهای انقلابی و تأثیرگذار ازجمله سپهبد قرنی، آیتالله مطهری، حاج مهدی عراقی، آیتالله قاضی طباطبایی، آیتالله مفتح و… را در برداشت سهگانه «زر، زور، تزویر» قرار دادند و با صدور فتوای «اعدام انقلابی»، اقدام به ترور آنها کردند.
اکبر گودرزی و بیشتر افراد گروه فرقان، طی عملیات تعقیب و مراقبت در ۱۸ دی ۱۳۵۸ دستگیر شدند. پس از آن روند بازجویی و برخورد فکری با گودرزی و اعضای گروه فرقان آغاز شد. نقش محوری برخورد فکری و بازگشت بیشتر فرقانیها را شهید سیداسدالله لاجوردی برعهده داشت. دادگاه اکبر گودرزی در ۱۷ اردیبهشت ۱۳۵۹ به ریاست حجتالاسلام و المسلمین ناطق نوری و عبدالمجید معادیخواه برگزار شد. حکم دادگاه برای گودرزی اعدام بود. این حکم در رابطه با اکبر گودرزی و ۵ نفر دیگر از اعضای گروه فرقان در ۳ خرداد ۱۳۵۹ اجرا شد.